Non capisco bene cosa vuol dire "ne' modificato il contratto (avrebbe dovuto sostenere lei le spese ed e' una persona con molte difficolta' economiche)", parto dal presupposto che senza nessun atto scritto sia la busta paga sia i contributi siano stati versati sulla base di 2,5 ore settimanali.
Dunque, se vi fosse un qualsiasi scritto di modifica del part-time non vi sarebbero dubbi, la 13a spetta sulle effettive 2,5 settimanali (salvo gennaio dove l'orario era ancora a 5 ore). Ora diventa un pò più complicato dimostrare che la riduzione d'orario è avvenuta per accordo consensuale e non per imposizione del datore di lavoro.
Direi comunque che la situazione di fatto è quella su cui effettuare i conteggi, essendo la 13a conseguenza delle effettive retribuzione corrisposte nel corso dell'anno.
Cordiali saluti.