Non vi sono problemi per quanto riguarda il rateo di tredicesima e il rateo di tfr.
Per quanto riguarda il rateo di ferie, le consiglierei di gestire la maturazione ad ore: in questo modo durante i mesi, ad esempio, con 40 ore lavorative settimanali, il lavoratore matura un numero doppio di ore di ferie rispetto ai mesi con 20 ore di lavoro settimanali.
Se le ferie vengono gestite a giorni, una giornata di ferie, pagata 8 ore perchè corrispondente ad una settimana di 40 ore, se goduta in un mese dove si lavora a 20 ore settimanali, la giornata di ferie verrebbe pagata ad esempio 4 ore.
Spero di essere stato chiaro.